Protein ZmALF17 | |
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Information | |
TF Name: | ZmALF17 |
Species: | Maize |
TF Family: | Alfin-like |
Gene Name(Synonym): | ALF17 |
Uniprot ID: | B4F867 |
ZmALF17 is a protein in the Alfin-like family.
Overview of domains present in v5 transcripts | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Alfin-like | PF00628 | PF01535 | PF06136 | PF12165 | PF12854 | PF13041 | PF13812 | PF17177 | |
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Zm00001eb211940_T001 |
Gene ID | Type | MEME Logo | Sequence | FIMO | Position |
---|---|---|---|---|---|
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VGNLGAIHRLSEHMRKFYNVAMARRFAITQKKKSIGLRRK
Secondary Structure Color Code | |
---|---|
BEND | region with high backbone curvature without specific hydrogen bonding |
HELX_LH_PP_P | left-handed polyproline helix |
HELX_RH_3T_P | right-handed 3-10 helix |
HELX_RH_AL_P | right-handed alpha helix |
HELX_RH_PI_P | right-handed pi helix |
STRN | beta strand |
TURN_TY1_P | type I turn |
UNDETERMINED | no data available |
Domains Present | |
---|---|
PF13041 |
|
PF01535 |
|
PF13812 |
|
PF01535 |
|
PF13041 |
|
PF12854 |
|
PF01535 |
|
PF13812 |
|
PF13041 |
|
PF12854 |
|
PF17177 |
|
PF13812 |
|
PF01535 |
|
PF17177 |
|
PF12854 |
|
PF01535 |
|
PF13812 |
|
PF13041 |
|
PF12854 |
|
PF13041 |
|
PF01535 |
|
PF13812 |
|
PF12854 |
|
PF01535 |
|
PF13041 |
|
PF17177 |
|
PF13812 |
|
PF12854 |
|
PF13041 |
|
PF01535 |
|
PF12854 |
|
PF13041 |
|
PF01535 |
|
PF13812 |
|
PF12854 |
|
PF01535 |
|
PF17177 |
|
PF13812 |
|
Hover here to show all domains |
GATCTCAACCGTCTGTTCTCTCTCG...
GATCTCAACCGTCTGTTCTCTCTCGCCTCCATTTTGATCGTCCGTCGGATGCTGCCCACGCGCGCGTGCGTCTCCCACTCTCCCTGCTCGTCACCCACCACTCTCCAGTCCACACGAGCAACCCCTTCCACCCGCCTCCCCCCACACCCAATCCCTAACCTCCCTCCGCCTCCCCCGACCTCGCTCCCGAATAGGATCTATGATGCCGTGATTAAGACGGGGACGGAATCCAACGCGGGCAAGGCCGCGCTCGACGCGTTGGGCGCTGAGCTGACTACCCCTCTCGTCGCCGACGTGCTGCACCGCCTCCGCTACGAGGAGAAGCTGGCGTTTCGGTTCTTCGCCTGGGCGTCCCAACAGGACGGCTACAACCACGAACCGACGACTTACAACGACATCATCGACATTCTCTCCGGCACGCGATACAAGAGCCGCCAGTTCGGTGTCCTCTGCAACGTGCTCGATCACATGAAGCGCCATGGCTCGAGGTCGGTGCCGGTTGAGGACCTTCTGGAGATCCTGCGCGCCTACACGGAGAAGCATCTCACGCACATGAGAAAGCTGGCCAAGAAGCGGCGGGTTCGGATGCGTACGCCGCCAGAGACTGATGCGCTCAACGTTCTGCTGGACGCGTTCTGCAAGTGTGGGATGGTCAAGGAAGCAGAGGCAGTGTTTGGTCGCGTGAAGAGGAAGTTGCTGGGTAATGCAGAGACATACAGTACCCTGTTCTTCGGGTGGTGCCGGGCGAGGGACCCCAAGAAGGCCATGAAGGTGCTCGAGGAAATGATTCAGATGAAGCACACGCCAGAGAGTTTCACCTACGTTGCAGCCATTATATCATTTTGCAGCGCTGGATTGGTGTCAGAGGCAAGGGAACTGTTTGAGTTCATGAGGACTGAGGGGTTGACGATATCATCGCCCACAGCCAAAACATATTCGATTATGATTGTTGCATTAGCAAAGGCTGACCGGATGGAGGAGTGTTTTGAACTGCTTTCAGACATGAGAAGTTGTGGCTGTATGCCTGACGTGACGACTTATAAAGATTTGATTGAAGGGATGTGCTTGGTGGGTAAACTGGATGCTGCTTATCGTGTGTTGGACGAGATGGGGAGGGCTGGATTTCCTCCTGACATTGTCACGTATAATTGCTTTCTTAATGTGTTTTGTAGTCATCGAAAGGCTGATGATGCACTTGAACTCTGTGAGAGGATGATAGAGGCACACTGTGAGCCCAGTGTTCATACCTATAATATGATGATGATGATGTTCTTCGAGATGGGAGAGGCACATAGAGCATTAGATATATGTCTTGAGATGGACAAAAGAAGATGTCAACGTGCTATCGATACCTACGAGATAATGATCTATGGTCTCTTTGATTGTGGAGAAACAGAATATGCAACTGCTCTTCTAGATGAGGTTATAAACCGTGACATGAAACTTTCATACAAGAAGTTTGATGCTATAATGCTGAGGTTATCAGATGTAGGCAACCTTGGCGCGATACATCGGTTGTCAGAGCATATGAGGAAATTTTACAATGTTGCGATGGCGAGACGATTTGCAATCACTCAGAAGAAAAAGAGCATAGGCCTGAGAAGGAAATGAGTGTCGTGGCTATTGCTGCTGCTGTTTCTTGTTAGTTGTTACTGTGGATAATCAGGAGCTTATTCAAAGGATCAGAAGGCTGATGAAGCTATTTTGGAAGTGTTAGACCTTCGATGGTATGCCATTGGACCAAAGTATTAATTATATATGCAACGCTTGTATCATCTGTTCCACTAATACCAGCAGTGTGCTATTGCTGTTTGTTCT
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RGCSGVFHLATPCTVYPVSDPQGQMVVPAVEGTLNVLRAAKEARTVRRVVVTSSSSAIIPSPAWPAGEPRDERCWADVDY
CKKNEVWYPVSKTLAEKAAWRFAEENGVDVVVVNPVTAMGPMIPPTINCSMIVLLRLLQGCTEEYRDIWMGAVHVHDAAM
AHILVFESPAASGRHICAQSISHWSDFAAKVAELYPEYKVPKFPKDTQPGLVRQGAEEGSKKLVALGLHFSPLEKIIRDA
VEALKSRGYIS
CCTTGAGAAAATGGAGTTTCTAAAC...
CCTTGAGAAAATGGAGTTTCTAAACTAGTTCTTATCTTTTTTTCCCAGTTTTATCCTTAGAGGGCAGATGCTGCTGCAGCTCAAGATAGCCACACACACAGACAGTGACACACTTAAGAGCTCGAGATCTCACTCTCCTCACCTCAGCTCTCAGAGAGGAAGGACACTGCGGCCGGGCGATGGCGAGCGTGGAGGGCAAGAGGGAGACGGTGCTGGTCACCGGCGCCAGCGGCTTCATCGGATCGACCCTCGTCGGCCTCCTCCTCGACCGCGGCTACAACGTCCACGCCAGCGTCCTCAACCCCGATGACAAGGCGGAGACGGAGCACCTGGTCGCCCTGGGCGCCGGCGCCGGCGAGGGCCGGCTGCGAGTCTTCCCGGGCGACCTCCTCGACGGCGCCGCGCTCATGGCCGCCGCGCGGGGCTGCTCGGGCGTGTTCCACCTCGCCACCCCCTGCACCGTCTACCCCGTGAGCGACCCGCAGGGGCAGATGGTGGTGCCGGCGGTGGAGGGCACGCTCAACGTCCTGCGCGCCGCCAAGGAGGCCCGCACCGTGCGGCGGGTGGTGGTCACCTCGTCCAGCTCCGCCATCATACCCAGCCCCGCGTGGCCCGCCGGCGAGCCCCGCGACGAGCGGTGCTGGGCCGACGTCGACTACTGCAAGAAGAACGAGGTCTGGTACCCTGTTTCCAAGACGCTGGCAGAGAAGGCGGCGTGGAGGTTTGCGGAGGAGAACGGGGTAGACGTGGTTGTCGTCAACCCGGTGACTGCCATGGGCCCAATGATTCCGCCCACCATCAACTGCAGCATGATCGTGCTCCTACGCCTGCTACAAGGTTGCACGGAGGAGTACAGGGACATCTGGATGGGGGCGGTGCATGTGCACGACGCCGCCATGGCGCATATCCTGGTGTTCGAGAGCCCGGCAGCGTCCGGGAGGCACATCTGCGCCCAGTCCATCTCCCACTGGAGCGACTTCGCGGCCAAGGTCGCCGAGCTGTACCCTGAGTACAAGGTGCCCAAGTTCCCCAAGGATACCCAGCCTGGGCTGGTGCGACAGGGAGCCGAGGAGGGGTCCAAGAAGCTCGTCGCGTTGGGGCTGCACTTCAGCCCTCTGGAGAAGATCATCAGGGACGCTGTGGAGGCCCTCAAGAGCAGAGGCTACATTTCGTAGCTAGCCGACCGACGGCAGCTATAGTGGAGTAGTATGCCTGTCGAATTTCGATTCCCAAGTGGCAAATTCTGCAAAACGAGTTCGCCAATATGAACAATAAATAAAGAACGTTGTGATAAAATAAAGCAGATTTTCTGTTGCATTTGGCCCTTCAAAGCATCCGTGGTGGTAAGATTTCC
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RGCSGVFHLATPCTVYPVSDPQGQMVVPAVEGTLNVLRAAKEARTVRRVVVTSSSSAIIPSPAWPAGEPRDERCWADVDY
CKKNEVWYPVSKTLAEKAAWRFAEENGVDVVVVNPVTAMGPMIPPTINCSMIVLLRLLQGCTEEYRDIWMGAVHVHDAAM
AHILVFESPAASGRHICAQSISHWSDFAAKVAELYPEYKVPKFPKDTQPGLVRQGAEEGSKKLVALGLHFSPLEKIIRDA
VEALKSRGYIS
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CCTTGAGAAAATGGAGTTTCTAAACTAGTTCTTATCTTTTTTTCCCAGTTTTATCCTTAGAGGGCAGATGCTGCTGCAGCTCAAGATAGCCACACACACAGACAGTGACACACTTAAGAGCTCGAGATCTCACTCTCCTCACCTCAGCTCTCAGAGAGGAAGGACACTGCGGCCGGGCGATGGCGAGCGTGGAGGGCAAGAGGGAGACGGTGCTGGTCACCGGCGCCAGCGGCTTCATCGGATCGACCCTCGTCGGCCTCCTCCTCGACCGCGGCTACAACGTCCACGCCAGCGTCCTCAACCCCGATGACAAGGCGGAGACGGAGCACCTGGTCGCCCTGGGCGCCGGCGCCGGCGAGGGCCGGCTGCGAGTCTTCCCGGGCGACCTCCTCGACGGCGCCGCGCTCATGGCCGCCGCGCGGGGCTGCTCGGGCGTGTTCCACCTCGCCACCCCCTGCACCGTCTACCCCGTGAGCGACCCGCAGGGGCAGATGGTGGTGCCGGCGGTGGAGGGCACGCTCAACGTCCTGCGCGCCGCCAAGGAGGCCCGCACCGTGCGGCGGGTGGTGGTCACCTCGTCCAGCTCCGCCATCATACCCAGCCCCGCGTGGCCCGCCGGCGAGCCCCGCGACGAGCGGTGCTGGGCCGACGTCGACTACTGCAAGAAGAACGAGGTCTGGTACCCTGTTTCCAAGACGCTGGCAGAGAAGGCGGCGTGGAGGTTTGCGGAGGAGAACGGGGTAGACGTGGTTGTCGTCAACCCGGTGACTGCCATGGGCCCAATGATTCCGCCCACCATCAACTGCAGCATGATCGTGCTCCTACGCCTGCTACAAGGTTGCACGGAGGAGTACAGGGACATCTGGATGGGGGCGGTGCATGTGCACGACGCCGCCATGGCGCATATCCTGGTGTTCGAGAGCCCGGCAGCGTCCGGGAGGCACATCTGCGCCCAGTCCATCTCCCACTGGAGCGACTTCGCGGCCAAGGTCGCCGAGCTGTACCCTGAGTACAAGGTGCCCAAGTTCCCCAAGGATACCCAGCCTGGGCTGGTGCGACAGGGAGCCGAGGAGGGGTCCAAGAAGCTCGTCGCGTTGGGGCTGCACTTCAGCCCTCTGGAGAAGATCATCAGGGACGCTGTGGAGGCCCTCAAGAGCAGAGGCTACATTTCGTAGCTAGCCGACCGACGGCAGCTATAGTGGAGTAGTATGCCTGTCGAATTTCGATTCCCAAGTGGCAAATTCTGCAAAACGAGTTCGCCAATATGAACAATAAATAAAGAACGTTGTGATAAAATAAAGCAGATTTTCTGTTGCATTTGGCCCTTCAAAGCATCCGTGGTGGTAAGATTTCC
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